Fiji ImageJ 사용법 - Fiji ImageJ sayongbeob

1.1. 아래 링크에서 ImageJ-Fiji를 다운로드 받습니다.

• Download Link : https://imagej.net/Fiji/Downloads
• 여기서는 Windows-64bit 버전을 기준으로 하겠습니다.

1.2. 압축을 풀면 다음과 같이 Fiji.app 폴더 안에 프로그램이 담겨 있습니다.

• C:\Program Files에 복사하지 마세요. 쓰기 권한 문제가 생길 수 있습니다
  

  
  

• C:\Users\[본인계정] 아래에 다음과 같이 Fiji.app을 복사합니다.
  

  
  

• C:\Users\[본인계정]\Fiji.app 으로 들어갑니다.

• 이 중 ImageJ-win64.exe를 클릭하시면, 다음처럼 ImageJ-Fiji가 실행됩니다.
  

  
  

• 종종 다음과 같은 update메시지가 나올 때가 있습니다. 받읍시다.
  

  
  

• Update source를 설정합니다. OK를 눌러서 진행합니다.
  

  
  

• ImageJ가 생각보다 많이 받아옵니다. 잠시 기다립니다.
  

  
  

• ImageJ 업데이트가 완료되었습니다. 사용할 준비가 되었습니다.
  

  
  

1.3. 윈도 시작화면에 고정.

• ImageJ에서 우클릭, 시작 화면에 고정을 클릭하면,

• 시작버튼을 누르고 클릭하기 좋게 아이콘이 박힙니다.
  
  

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[유틸리티] 이미지 처리에 필수인 ImageJ 살펴보기!

• 2020.10.25 11:48
• Computer/Utility

소개

ImageJ는 미국 국립보건원(NIH)에서 연구용으로 만든 Java 기반의 이미지 처리 프로그램입니다. Java 플러그인을 통해 기능을 확장할 수 있도록 개방형 아키텍처로 설계되어있어, 플러그인을 설치하면 더욱 다양한 기능을 사용할 수 있습니다.

참고로, Mono 8bit 및 RGB 24bit 포맷이 아닌 이미지 파일을 Windows에서 제공하는 사진 프로그램으로 불러오면, 정상적으로 표시가 되지 않습니다. 포토샵같이 전문적인 프로그램 외에, ImageJ나 GIMP와 같은 프로그램을 사용해야 제대로 확인할 수 있습니다.

특징

주요 특징을 알아볼까요?

• Lunux, Mac OS X, Windows 모두 실행 가능하며, 32bit 및 64bit 지원.
• Java Source code 자유롭게 사용 가능.
• 플러그인으로 기능 확장가능.
• 세계에서 가장 빠른 pure Java 이미지 처리 프로그램.
• 8bit, 16bit, 32bit 및 RGB Color 포맷 지원.
• GIF, JPEG, BMP, PNG, DICOM, RAW 등 다양한 파일 포맷 지원.
• Image Enhancement, Geometric Operations, Analysis, Editing, Color Processing, Stacks 등 다양한 처리 지원.

다운로드 방법

ImageJ 공식 홈페이지에 접속하여 다운로드할 수 있습니다.

링크: imagej.nih.gov/ij/download.html

Download

imagej.nih.gov

OS에 맞는 다운로드 항목을 선택합니다.

다운로드하면 압축 파일이 있고, 압축을 해제하면 실행파일이 있습니다. 설치형이 아니므로 편리하게 바로 실행 가능합니다.

플러그인으로 기능 확장하기

ImageJ는 500개가 넘는 플러그인을 지원하고 있습니다. 저 같은 경우에는 기본 기능으로 충분해서 플러그인을 사용하진 않지만, 찾아보면 유용한 플러그인이 많습니다.

링크: imagej.nih.gov/ij/plugins/index.html#utilities

Plugins

Contents     Acquisition     Analysis     Collections     Color     Filters     Segmentation     Graphics     Input/Output     Programming Examples     Scripting     Stacks     Tools     Toolsets     

imagej.nih.gov

플러그인으로 제공하는 주요 기능은 다음과 같습니다.

• Acquisition
• Analysis
• Collections
• Color
• Filters
• Segmentation
• Graphics
• Input/Output
• Scripting
• Stacks
• Tools
• Toolsets
• Utilities

설치 방법은 아주 간단합니다. 본문에서는 예시로 Segmentation > Otsu Thresholding을 설치해 보겠습니다. 아래와 같이 다운로드할 플러그인 이름을 클릭합니다.

특정 플러그인 페이지로 이동하면, 해당 플러그인을 다운로드합니다.

다운로드한 플러그인 파일을 ImageJ > plugins 경로 또는 하위 폴더 어디에든 분류하여 붙여 넣습니다.

마지막으로 ImageJ를 재실행하면, 다운로드 받은 플러그인 메뉴가 표시되어 사용 가능합니다.

해당 플러그인의 실행 결과는 아래와 같습니다.

사용 방법

ImageJ를 실행하면 아래와 같이 작은 툴 바(Tool bar) 형태로 실행됩니다.

이미지 불러오기

이미지를 불러올 때에는 File > Open 메뉴를 클릭하거나, 이미지 파일을 Drag & Drop 하여 불러올 수 있습니다.

확대/축소하기

Ctrl + 마우스 휠을 사용하여 확대/축소가 가능하고, 확대 상태에서 Drag & Drop으로 이동하고 싶으면 아래 아이콘을 클릭하면 됩니다.

이미지 분석하기

Histogram 및 Plot Profile, Pixel Area/Min/Max 등 이미지 분석 기능은 Analyze 메뉴를 통해 사용 가능합니다.

이미지 처리하기

각종 Filter 처리, FFT 변환 및 각종 이미지 처리 관련 연산은 Process 메뉴를 통해 사용 가능합니다.